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助力健康
发掘疾病靶点
新使生物旨在为研究者提供强大的工具
NSMB| RfaH介 导的转录-翻译偶联的结构基础
08-13
导读细菌中的转录和翻译在同一细胞区室内同步进行,大肠杆菌中,转录-翻译耦合涉及RNA聚合酶(RNAP)和核糖体之间的物理配对,这种耦合由NusG和RfaH因子调控:A)NusG是一个通用的耦合因子,与RNAP和核糖体蛋白S10相互作用,支持转录和翻译的协调。B)RfaH是一个特定的调控因子,...
Cell Res | Ribo-seq应用:SMYD5增强翻译产出并促进肝细胞癌的发展
08-09
导读蛋白质赖氨酸Nε-甲基化在生物过程中非常重要,尽管其对转录调控的影响已被广泛研究,但其在翻译中的作用仍未深入探索。一些哺乳动物核糖体蛋白,如RPL4、RPL29、RPL40和RPL36A,它们被发现含有赖氨酸甲基化,特别是RPL40:A)它是由UBA52基因编码的,去除泛素后的成熟形式为...
Mol Cell | 不依赖连接的建库方法LIDAR揭示3'末端封闭的tRNA衍生RNAs
08-06
导读原核细胞和真核细胞合成的RNA种类繁多,大小和功能各异。RNA分类的一个标准是其编码能力,这区分了编码蛋白质的RNA(mRNA)和非编码RNA(ncRNA)。非编码RNA包括结构性ncRNA(如rRNA和tRNA)、参与剪接和rRNA生成的snRNA和snoRNA,以及调控性ncRNA(如p...
SCR | Polysome profiling应用:揭示ZZZ3对人类胚胎干细胞稳态中mTOR/核糖体通路的影响
08-02
胚胎干细胞(ESCs)具有无限自我更新和多能性,能够分化成三种胚层。这种动态特性源于基因表达的大幅波动,形成了多样的蛋白质景观。在小鼠ESCs中,多能性和增殖可以是独立的过程,这意味着小鼠ESCs可以在保持多能性的同时不积极增殖。这种多能性维持与细胞分裂的分离是由哺乳动物雷帕霉素靶蛋...
NC | ABC-F蛋白EttA通过调节翻译暂停实现全局性调控
07-30
导读ATP结合蛋白F(ABC-F)家族属于ABC超家族,其成员均涉及核糖体相关功能,广泛存在于细菌和真核生物中。通常一个生物体内有多个同源物,例如大肠杆菌有四种ABC-F蛋白:EttA、Uup、YheS和YbiT。ABC-F蛋白由两个ABC结构域组成,含有P位tRNA相互作用基序(PtIM),...
NAR | mRNA poly(A)尾部长度对真核生物翻译阶段的影响
07-26
导读3'端的多腺苷酸化对于mRNA的稳定性和蛋白质合成调控至关重要。该修饰保护mRNA免受降解,并通过与多腺苷酸结合蛋白(PABP)互动,调控蛋白质合成。初级多腺苷酸化在细胞核内进行,产生150到250个核苷酸的多腺苷酸尾巴。在细胞质中,这些尾巴会缩短并可能再次延长,最终稳定在80到100个...
NC | 人类死后大脑与活体大脑中A-to-I编辑的差异
07-23
导读转录后RNA修饰在中枢神经系统(CNS)复杂功能中扮演重要角色。其中,腺苷核苷酸向次黄嘌呤(A-to-I)的转化在人类大脑中广泛存在,这导致A-to-G的转录后转变。ADAR酶驱动RNA转录本的这些转化,支持多种分子功能。A)ADAR1存在P110和P150两种同工型,负责编辑内源性长双链R...
Immunity | 经典的抗病毒蛋白寡腺苷酸合酶1通过增强IRF1的翻译发挥抗细菌感染的功能
07-19
导读干扰素(IFN)刺激的基因(ISG)不仅能抵抗病毒感染,还具有抗菌功能。2'-5'寡腺苷酸合成酶(OASs)是ISG的一类,通过合成2-5A分子激活RNase L降解RNA,抑制翻译水平。尽管OAS蛋白与抗结核反应有关,其具体机制尚不明确。OAS家族基因在后生动物中表现出广泛的突变和快速进...
Mol Cell | 李笑雨和伊成器开发全新碱基分辨率级m⁵C测序技术
07-16
导读研究学者们在各种RNA类型中已经发现了超过170种转录后修饰,它们在基因表达调控中发挥着多样的作用。其中,5-甲基胞嘧啶(m5C)是一种常见的RNA修饰,存在于rRNA、tRNA和mRNA中。在mRNA中,m5C可以被特定识别蛋白(如ALYREF、YBX1、YBX2、FMRP和SRSF2)识...
NC | Ribo-seq技术应用:tRNA m1A修饰通过mTORC1信号调控造血干细胞的维持和更新
07-12
导读造血干细胞(HSCs)是骨髓中罕见的成体干细胞,具有自我更新和多向分化能力,终身维持血细胞生成。为了应对复制、代谢、氧化和基因毒性等各种压力,HSCs发展了多种适应机制,但其完整适应机制仍未完全理解。HSCs经历快速的静止状态打破、大规模克隆扩增和分化,这对于有效的造血重建至关重...
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