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NC | Polysome profiling应用:RNA G-四链体如何调控线粒体翻译与能量代谢,影响癌细胞生长

来源:新使生物时间:2025-04-08 15:09
导读
越来越多证据表明,线粒体代谢在癌细胞中是活跃的,满足其能量和合成需求,并促进肿瘤生长。随着肿瘤进展及治疗应答,癌细胞对线粒体功能的依赖增强。
线粒体功能主要依赖于核编码mRNA在细胞质中的翻译,所得蛋白被导入线粒体,参与呼吸链13个线粒体编码蛋白的合成,从而驱动氧化磷酸化(OXPHOS)产能。研究发现,大部分线粒体蛋白mRNA在翻译依赖下富集于线粒体外膜(OMM),并在此由相关核糖体局部翻译,调控蛋白输入,而这一过程在癌症中的机制尚不清楚。
mRNA翻译是细胞最耗能过程,其异常是癌症特征之一。 翻译重编程可选择性调控特定mRNA“调控子”,介入癌症相关通路。尽管该策略具有治疗潜力,但RNA元件、结构及结合蛋白等分子基础仍不明,可能涉及特定局部翻译工厂。
RNA G四链体(RG4s)是富G序列形成的特殊结构,其在体内外被广泛观测到,由RNA结合蛋白和解旋酶动态调控。虽然RG4在癌症相关mRNA翻译中的功能逐渐被认识,但其调控mRNA“调控子”的证据仍有限。
近期研究提出RG4可能参与核编码线粒体mRNA的细胞质翻译,进而影响线粒体蛋白合成。这与G4结构在调控线粒体复制、转录和RNA稳定性中的作用一致,尽管RG4是否通过调控细胞质翻译影响线粒体功能仍需进一步验证。
2025年4月7日,法国图卢兹大学Stefania Millevoi团队在Nature Communications上发表了一篇题为“RNA G-quadruplexes control mitochondria-localized mRNA translation and energy metabolism”的论文,揭示细胞质中的RG4结构通过调控在线粒体外膜处对核编码线粒体mRNA的细胞质翻译,从而影响线粒体功能。其作用是通过RG4与RNA结合蛋白hnRNP U的相互作用介导,并受到致癌信号通路mTOR的调控,最终改变了线粒体功能,进而影响能量代谢与癌细胞的增殖。

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文章索引

【标题】RNA G-quadruplexes control mitochondria-localized mRNA translation and energy metabolism
【发表期刊】Nature Communications

【发表日期】2025年4月7日
【作者及团队】法国图卢兹大学Stefania Millevoi团队

【IF】14.7


研究结果

一. RG4s影响线粒体基因表达与功能
作者发现含RG4结构的mRNA显著富集于线粒体相关功能项,且其编码的线粒体蛋白在RG4配体cPDS处理后差异表达,提示RG4s可能调控线粒体基因表达和呼吸功能。
荧光探针BioCyTASQ进一步显示部分细胞质RG4s定位于线粒体附近,其稳定化增强RG4信号并改变分布模式。

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二. RG4s是定位于线粒体外膜翻译的分子决定因子

RG4结构促进核编码线粒体mRNA在线粒体外膜(OMM)处的局部翻译。RG4稳定化(如PhenDC3处理)会削弱其与线粒体的共定位,抑制翻译。

突变RG4或阻断其形成同样降低翻译效率,表明RG4是OMM定位翻译的重要顺式元件,其动态变化对线粒体功能调控至关重要。

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三. hnRNP U结合到含RG4的核编码线粒体mRNA

研究者发现hnRNP U结合RG4,特别是核编码的线粒体mRNA,影响其结构平衡。

hnRNP U富集于细胞质,能优先结合RG4序列,且与代谢重编程通路相关。其可能通过与解旋酶合作,促进RG4解开,调控mRNA的翻译。

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四. hnRNP U定位于外线粒体膜并与翻译机械和核编码线粒体蛋白相互作用

hnRNP U定位于外线粒体膜(OMM),与核编码线粒体mRNA、翻译元件(如核糖体、RG4结合蛋白和解旋酶DDX3X)以及线粒体蛋白相互作用。

作者通过纯化线粒体和RNA拉下实验,发现hnRNP U优先与折叠的RG4结合,分析揭示它与翻译和线粒体翻译相关的蛋白质互作。

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五. hnRNP U调控RG4含量mRNA靶标在外线粒体膜(OMM)上的蛋白质合成

研究发现,Polysome profiling多聚核糖体分析显示hnRNP U通过与多聚核糖体的结合,调控含RG4的核编码线粒体mRNA的翻译。hnRNP U的去除选择性地抑制了这些mRNA的翻译,而整体蛋白质合成未受影响。

mTOR通路通过调节RG4结构和hnRNP U的磷酸化,进一步调控这一翻译过程。这揭示了mTOR-hnRNP U-线粒体翻译轴,调控细胞的能量生产。

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六. hnRNP U通过调控OXPHOS复合物蛋白的合成影响氧化代谢

hnRNP U沉默降低OXPHOS复合物表达,抑制线粒体呼吸和ATP生成,并减少糖酵解。

DDX3X和hnRNP U沉默共同减少这些代谢功能,恢复hnRNP U表达可恢复代谢功能。RG4稳定化也抑制OXPHOS和糖酵解,表明hnRNP U调节氧化代谢与糖酵解的平衡。

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七. hnRNP U、DDX3X和GRSF1在转录调控中协同作用,调节RG4含量的核编码线粒体mRNA的翻译

研究表明,hnRNP U、DDX3X和GRSF1共同参与调控RG4含量的核编码线粒体mRNA的翻译。它们通过互相作用,协同维持RG4结构未折叠状态,从而影响线粒体功能和能量代谢。

hnRNP U和DDX3X的相互作用并不相互调节表达,且联合沉默两者对线粒体蛋白表达的影响与单独沉默相似,支持顺序招募模型。

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总结

癌细胞依赖线粒体提供能量和合成大分子,线粒体蛋白合成调控在此过程中至关重要。本文揭示RNA G-四链体(RG4s)通过调节核编码线粒体蛋白的细胞质翻译,影响线粒体功能,进而影响能量代谢和癌细胞增殖。

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