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助力健康
发掘疾病靶点
新使生物旨在为研究者提供强大的工具
NCB | Polysome profiling应用:揭秘癌症翻译密码——RBM42如何精准调控致癌基因表达
02-14
导读癌基因mRNA编码的蛋白剂量严格受控,以维持正常细胞稳态,而癌细胞则依赖高水平的癌基因蛋白以促进生长和生存。其中,Myc作为关键转录因子,在癌症中需维持高表达,对肿瘤发生至关重要,但其转录后调控机制仍不清楚。5′ UTR介导的转录本特异性翻译控制可能是调节Myc表达的关键。尽管5′ U...
NAR | Ribo-seq应用:揭秘线粒体无5' UTR mRNA翻译——起始tRNA和密码子的选择如何影响能量生成
02-11
导读哺乳动物线粒体具有独特的蛋白质合成系统,专门合成氧化磷酸化复合体的13个亚基。其翻译机制类似于细菌,但已演化出特异性功能,如合成疏水性膜蛋白并促进共翻译膜插入。翻译因子虽保留细菌同源核心结构,但常有额外序列,以增强与核糖体、tRNA和mRNA的特异性相互作用。线粒体DNA编码13种...
Mol Cell | Ribo-seq应用:METTL1——超越甲基转移酶,促进tRNA氨酰化与癌变!
02-07
导读癌症基因组是由突变塑造的,这些突变改变了DNA的序列或结构,并伴随着肿瘤演化。对单个基因反复突变的识别推动了致癌基因和肿瘤抑制基因的发现,但多基因遗传损伤(如染色体数目异常或局部拷贝数改变)在癌症中普遍存在,目前尚不清楚哪些基因驱动肿瘤演化,哪些为“乘客基因”。这种区分对癌症...
NC | 深度学习解码正常与癌组织中的RNA翻译位点
02-05
RNA翻译调控决定蛋白质丰度,尤其在癌症等疾病中受多种遗传与非遗传因素影响。RNA翻译是一个复杂的过程,由40S和60S核糖体亚基依次结合RNA,并伴随多种真核起始因子及辅助因子,最终形成活性核糖体。核糖体印迹分析(Ribo-seq)近年来广泛用于评估mRNA的翻译效率,精准挖掘非典型开放阅...
Cell | Ribo-seq应用:共翻译蛋白质复合物组装的结构决定因素
01-24
导读生物大分子的结构对细胞功能至关重要,蛋白质的结构涉及折叠成三维结构和组装成多组分复合物。蛋白质折叠的生物物理研究主要集中在小型球状蛋白质上,但这些仅占细菌蛋白组的不到10%,其余90%的蛋白质更易错折叠或聚集,尚未深入探讨。蛋白质复合物的组装可以是翻译后或共翻译过程。共翻译组装是指...
DC | Polysome profiling应用:斑马鱼胚胎发育中5′ UTR在翻译调控中的作用景观
01-21
导读翻译调控在胚胎发生中决定蛋白质合成的时机和程度。经典的真核翻译起始需要核糖体前起始复合物(PIC)先招募到5'帽结构,再扫描5'非翻译区(UTR),直到找到起始密码子,这使得5' UTR成为选择性翻译的调控点,而翻译起始可能是蛋白质合成的限速步骤。5' UTR包含影响翻...
Cell Rep | Polysome profiling应用:核糖体与P-stalk蛋白功能多样化调控晚期痘病毒蛋白合成
01-17
导读核糖体被认为是高度精确的代码读取机器,翻译效率主要由mRNA的序列和结构以及翻译因子活性决定。大多数mRNA通过帽依赖机制启动翻译,由约30种真核起始因子(eIFs)控制。近年来,核糖体功能多样化的认识逐步深入,有部分核糖体蛋白(RP)被认为是可缺失的,只对特定mRNA翻译必需。RP...
Cell Rep | 人类TRMT1和TRMT1L同源基因确保tRNA的正确修饰状态、稳定性和功能
01-14
导读tRNA中已被发现超过100种转录后修饰,许多修饰在tRNA的折叠、生物合成及基因表达调控中发挥关键作用,并影响发育、应激反应及肿瘤发生。大脑对tRNA修饰异常尤为敏感,相关酶的缺陷与多种认知障碍相关。然而,人类tRNA修饰酶的功能机制尚存诸多未知。酵母中Trm1p是最早被鉴定的tRNA...
NC | Polysome profiling应用:E4F1确保大脑发育过程中翻译准确性的机制
01-10
导读Leigh氏综合征(LS)是一种罕见的先天性神经退行性脑病,由丙酮酸代谢或电子传递链(ETC)中的线粒体功能障碍引起,表现为慢性乳酸血症和基底神经节及脑干的坏死性病变,患者常伴发肌张力低下、发育迟缓及早逝。目前尚无有效治疗,但生酮饮食或二氯乙酸(DCA)可改善部分症状。研究发现,...
NBE | 高效合成环状RNA,实现强效滚环翻译
01-07
导读外源mRNA引入细胞后可表达目标基因(GOI),构成了mRNA治疗的基础。然而,由于不稳定性、高免疫原性和低效递送等问题,其发展进展缓慢。尽管核苷酸修饰和RNA递送技术推动了mRNA疫苗的成功,mRNA的不稳定性仍制约了其他应用。环状RNA(circRNA)因抗外切酶而更稳定,是mRN...
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